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Los fatimís, shiís ismailitas de origen  incierto, fueron  perseguidos  por los  abasis  por lo que se dirigieron hacia Siria, desde allí a Palestina y Egipto para instalarse en Túnez. Aquí, Usaid Allah creó el califato fatimí.
Bajo el gobierno de Al-Muizz li-Din Allah (953-975) se consiguió conquistar Egipto. En 969 Gawhar, un  oficial esclavo, conquistó al-Fustat y mandó construir una nueva ciudad: al-Qahira  (“la Victoriosa”), que se convirtió en la capital del imperio fatimí en 973.
En 1169, Salah al-Din al-Ayyubi  (Saladino), al servicio del soberano sirio Nur al-Din, conquistó El Cairo y restauró la soberanía de los abasis y el sunnismo.